怀牛膝可培养内生真菌的多样性研究

摘要 [目的]探讨道地药材怀牛膝（Achyranthes bidentata Blume）内生真菌的多样性组成及定殖情况。[方法]通过组织块分离法，选取二年生怀牛膝茎部和根部作为分离对象，进行内生真菌分离，并采用形态学和分子生物学2种方法对分离得到的真菌进行鉴定。[结果]从怀牛膝材料中共分离纯化获得136株内生真菌，其中根部分离得到86株，茎部分离得到50株，根据形态和分子生物学特征，它们属于8目11科11属;其中，怀牛膝根部内生真菌定殖率较高（65.0%），茎部内生真菌定殖率较低（37.5%）。茎部分离的内生真菌只有8种，根部分离得到11种。[结论]怀牛膝根部内生真菌表现出了较高的种属多样性。在怀牛膝根部分离的内生真菌中，优势菌属是镰孢属和Moesziomyces。

关键词 怀牛膝;内生真菌;根部;茎部;多样性

中图分类号 S567.23+9  文献标识码 A

文章编号 0517-6611（2022）10-0149-03

doi：10.3969/j.issn.0517-6611.2022.10.033

Study on Diversity of Culturable Endophytic Fungi from Achyranthes bidentata Blume

SUN Si-sheng1，ZHANG Xiao-juan2，MA Chuan-gui3 et al （1.College of Food and Pharmacy，Xuchang University/Key Laboratory of Biomarker Based Rapid-detection Technology for Food Safety of Henan Province，Xuchang，Henan 461000;2.Quartermaster Engineering Technology Institute，Academy of Military Science of the CPLA，Beijing 100010;3.Beijing Jingcheng Biological Technology Co.，Ltd.，Beijing 102600）

Abstract [Objective] To explore the diversity composition and colonization of endophytic fungi in Achyranthes bidentata Blume.[Method]By the method of tissue block separation，the stems and roots of biennial Achyranthes bidentata were selected as the separation objects，and the endophytic fungi were isolated，and the isolated fungi were identified by morphological and molecular biology methods.[Result]A total of 136 endophytic fungi were isolated and purified from Achyranthes bidentata materials，of which 86 strains were isolated from roots and 50 strains from stems.According to morphological and molecular biological characteristics，they belonged to 8 orders，11 families and 11 genera.Among them，the colonization rate of endophytic fungi in the root of Achyranthes bidentata was higher （65.0%），and the colonization rate of endophytic fungi in the stem was lower （37.5%）.Only 8 species of endophytic fungi were isolated from the stem，and 11 species were isolated from the root.[Conclusion]The endophytic fungi in the root of Achyranthes bidentata shows high species diversity.Among the endophytic fungi isolated from the roots of Achyranthes bidentata， dominant genera were Fusarium and Moesziomyces.

Key words Achyranthes bidentata Blume;Endophytic fungi;Root;Stem;Diversity

基金项目 河南省科技攻关项目（192102310441，202102110055）;陕西省高校青年杰出人才支持计划。

作者简介 孙思胜（1982—），男，河南范县人，讲师，博士，从事药食两用植物资源综合开发与利用研究。通信作者，高级工程师，硕士，从事军用食品研究。

收稿日期 2021-08-07

怀牛膝（Achyranthes bidentata Blume）为苋科（Achyranthes）牛膝属（Achyranthes）多年生深根系草本植物，怀牛膝的使用历史悠久，且可作为保健食品原料，我国最早的药学著作《神农本草经》中将怀牛膝列为上品，久服可轻身延年。怀牛膝中含有甾酮、皂苷、多糖、黄酮和生物碱等成分，具有抗衰老、抗肿瘤、提高机体免疫力、促进蛋白质合成、抑制血糖升高、降胆固醇、使受损的骨样细胞再生、镇痛消炎等作用[1-6]。由于怀牛膝具有延缓机体衰老、降糖、增强免疫力、抗肿瘤等多方面的功效，在保健品、食品和药品中具有广阔的开发潜力。

植物内生真菌是指那些其全部或部分生活史在健康植物的各种组织或细胞内部度过的真菌，它们的存在不引起宿主感染明显的症状，但是它们可以通过组织学方法或严格表面消毒的方法从植物组织中分离或从植物组织内部扩增出微生物 DNA的方法来证明其内生性[7-8]。在长期医疗实践过程中，部分特定地域、特定生产过程所出产的药材较其他地区所产的同种药材表现出品质佳、疗效好的特点，逐渐形成了“道地药材”的概念[9]。道地药材的品质与疗效经历临床和生产的长期检验，其形成机制具有丰富的科学内涵。普遍的观点认为，中药材的道地性是在遗传因素和外在因素的共同作用下形成的。其中，药材自身遗传因素及其所表现出的生物学特性是药材道地性形成的内因，也是道地性形成的本质和基础。外在因素即适宜的生态地理条件（温度、水分、土壤、海拔、人工管理等）属于外因，是影响药材道地性的主要因素[10-11]。近年来的研究表明，环境微生物中与植物有紧密联系的内生菌对宿主植物的生长和次生代谢的影响不容忽视。因此该试验以道地产区温县的二年生怀牛膝为材料，研究怀牛膝内生真菌的多样性，为怀牛膝内生真菌多样性与怀牛膝内生真菌资源开发，以及进一步探究内生真菌多样性与怀牛膝药材道地性之间的关系奠定理论基础。

1 材料与方法

1.1 试验材料 采自河南省焦作市温县农科所种植基地健康的二年生怀牛膝植株。马铃薯培养基（PDA）配方（1 L）：去皮马铃薯200 g，葡萄糖20 g，琼脂12 g，去离子水定容至 1 000 mL，pH自然;122 ℃，灭菌22 min。孟加拉红培养基配方（1 L）：孟加拉红 35 g，去离子水定容至 1 000 mL，pH自然;122 ℃，灭菌22 min。

1.2 试验方法

1.2.1 怀牛膝内生真菌的分离。

采用组织块分离法[12-13]。随机选取健康的怀牛膝根、茎，清水洗净，无菌滤纸吸干水分，切成 1 cm 左右小段。在无菌条件下，浸入 75%乙醇中漂洗 30～60 s，然后再放入3%的次氯酸溶液中浸泡 8～12 min，无菌水冲洗4 次，再用无菌滤纸吸干水分。然后在无菌条件下，将表面消毒后的样品切成 0.2 cm×0.2 cm大小的组织块，从怀牛膝根部和茎部各随机选取120 个组织块，共计240个组织块用于怀牛膝内生真菌的分离。菌株用 PDA试管斜面保藏和10%甘油管妥善保藏;其中PDA试管放4  ℃冰箱保藏，10%甘油管放于-80  ℃超低温冰箱保存。

1.2.2 内生真菌的鉴定。

对分离的真菌编号之后，采用形态学和分子生物学2种方法对它们进行鉴定;先根据形态和显微特征以及产孢结构对能够产孢的菌株进行鉴定;再对不能产孢的菌株初步归为不产孢类群，然后利用分子生物学技术对其进行鉴定。

1.2.2.1 形态学特征鉴定。

将已经纯化好的真菌接种于PDA平板上，观察记录菌落形态、生长特性，结合显微结构中的孢子形态、大小和产孢结构等对其进行经典的形态鉴定[14-17]，同时，通过对相关文献的收集和查阅，最终能够鉴定出这些真菌在分类学地位上属于哪个属或哪个种。

1.2.2.2 分子生物学手段鉴定。

除经典形态鉴定外，该研究另外采用对真菌菌丝的核糖体rDNA的ITS序列扩增进行鉴定的方法。一方面，对形态鉴定结果能够相互验证，确保鉴定的准确性;另一方面，对一些经过诱导也不产孢子的真菌进行分子生物学手段的鉴定是目前普遍应用的一种方法。

具体方法是：将分离获得的真菌进行纯培养，提取核糖体rDNA，对转录间隔区（ITS1-5.8S-ITS2）进行扩增，扩增后获得的 DNA 片段500～750 bp的序列，将其与GeneBank（http：//ncbi.nim.nih.gov）中的数据对比，确定其种属类别。序列比对后，如果目标序列和参考序列有95%以上的同源性，就暂定到参考序列所在的属，如果有99%以上（包括99%）的相似性就暂定到种[18]。

1.3 菌株的保藏 把从怀牛膝根部和茎部中分离到的菌株进行编号、整理和鉴定后，将菌株的活体标本保藏于黄河科技学院纳米功能材料研究所微生物真菌保藏中心。

1.4 数据统计分析

（1）分离率（isolation rate，IR）。样本组织块中分离得到的菌株数占全部样本组织块数的百分比，用来衡量植物组织中内生真菌的丰富程度和每个组织块受多重定殖的发生频率。

（2）定殖率（colonization rate，CR）。样本中受内生真菌定殖的组织块数占全部组织块数的百分率，能够反映出同一植物不同组织受内生真菌的定殖程度。

（3）分离频率 （isolation frequency，IF）。分离得到的某种（类）内生真菌的菌株数占分离获得的总菌株数的百分率，用于反映不同种（类）的内生真菌在总菌群中的优势程度。IF>10%的内生真菌为优势属， 1%≤IF≤10%的内生真菌为常见属，IF<1%的内生真菌为稀有属。

（4）香农-威纳多样性指数（Shannon-Wiener index，H’）。H’=-（PilnPi），Pi 是指该品种（部位）某种内生真菌菌株数量占该品种（部位）所有分离到内生真菌菌株总数量的百分比，用来分析特定群落中内生真菌的类群多样性，群落中生物种类增多代表群落的复杂程度增高[10，15]。

2 结果与分析

2.1 怀牛膝内生真菌鉴定 从怀牛膝根部分离得到86株内生真菌，根据其形态学特征和分子生物学鉴定结果（表1），怀牛膝根部的 86株内生真菌分别属于子囊菌门粪壳菌纲肉座菌目丛赤壳科镰孢属的尖镰孢菌、腐皮镰刀菌以及1个不明种，肉座菌目球腔菌科Sarocladium的枝顶孢霉及1个不明种，肉座菌目Stachybotryaceae Albifimbria的 Myrothecium verrucaria，小丛壳目Plectosphaerellaceae Verticillium的Verticillium dahliae;座囊菌纲座囊菌目枝孢霉科枝孢霉属的Cladosporium cladosporioides，格孢腔菌目Phaeosphaeriaceae Phaeosphaeria 的1个不明种;担子菌门黑粉菌纲黑粉菌目黑粉菌科Moesziomyces 的Pseudozyma aphidis，微球黑粉菌纲锁掷酵母目锁掷酵母科红酵母属的1个不明种。共计2个门4个纲 6 个目 8 个科 8 个属和 7个种以及4个不明种。此外，在怀牛膝根部分离的菌株中，优势属为镰孢属和Moesziomyces，其中镰孢属的菌株数占总数的 44.19%，常有属占 30.23%。